在miRNA的研究中,验证miRNA与基因靶向关系是一个关键步骤。miRNA通过其种子序列(即5’端第2-8个碱基)靶向结合mRNA的3'UTR区域,这一结合能够诱导细胞内的沉默复合体介导的mRNA降解或抑制mRNA的翻译过程。基于这一机制,可以通过将目的基因的3'UTR区域(或结合位点下游500bp)插入到荧光素酶报告基因载体luciferase的下游,与miRNA模拟物(miRNA mimics)共同转染目标细胞,加入底物后检测荧光素酶活性的变化。如果观察到荧光素酶活性的显著下调,说明该miRNA与靶基因的3'UTR区域存在相互作用。
目前常用的载体包括PGL3-CMV-LUC-MCS。双荧光素酶报告基因检测使用这一方法来验证miRNA与靶基因3'UTR之间的相互作用,主要包含以下几个步骤:
- 靶基因的生物信息学预测: 通过生物信息学分析软件(如TargetScan、StarBase和miRanda等)分析特定靶基因的3'UTR区域序列是否存在miRNA结合位点。
- 插入目标序列:将预测能够与miRNA结合的靶基因3'UTR序列插入到荧光素酶(Firefly luciferase)的3'UTR中。当miRNA与插入的序列结合后,将会抑制荧光素酶的翻译,导致最终的荧光值降低。
- 相互作用的结构验证:通过实验步骤的执行,进一步分析结果。
通过上述步骤,双荧光素酶报告基因检测能够有效验证miRNA与靶基因3'UTR的相互作用,为研究miRNA的功能和调控网络提供了重要工具。
在使用尊龙凯时的双荧光素酶报告基因检测服务时,实验流程通常包括以下详细步骤:
材料与准备
- 细胞:HEK293细胞或目标细胞
- 转染试剂:推荐使用HieffTrans®invitrosiRNA/miRNATransfection Reagent
- 报告基因检测试剂:Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit
- 仪器耗材:酶标仪、细胞培养板等
实验步骤
- 确认目标细胞质粒瞬转效率,理想情况下,应达到40%以上。
- 将处于良好生长状态的细胞消化,并将其转移至24孔培养板中,培养至细胞覆盖率达到70%左右。
- 进行转染操作,并在转染48小时后收集细胞样品。
- 对细胞样品进行处理,提取裂解物后准备进行荧光检测。
- 根据报告基因检测试剂盒的说明书,进行相应检测,包括准备Renilla Luciferase Assay工作液,并按照规定参数进行荧光素酶的检测。
常规检测分组可设置为:
- mimics NC + 对照质粒 + 海肾内参(TK)
- mimics NC + 3’UTR野生型质粒 + 海肾内参(TK)
- mimics NC + 3’UTR突变型质粒 + 海肾内参(TK)
- mimics + 对照质粒 + 海肾内参(TK)
- mimics + 3’UTR野生型质粒(WT) + 海肾内参(TK)
- mimics + 3’UTR突变型质粒(MT) + 海肾内参(TK)
通过尊龙凯时提供的双荧光素酶报告基因检测服务,能够加速基础研究及药物筛选的进程。
相关产品清单
- 双荧光素酶报告基因检测试剂: Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit (货号:11402ES)
- 转染试剂: HieffTrans® Liposomal Transfection Reagent (货号:40802ES)
- 其他相关试剂: HieffTrans® invitrosiRNA/miRNA Transfection Reagent (货号:40806ES)